Informe Científico de Investigador
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Acceso Abierto Informe científico de investigador: Mistchenko, Alicia Susana (2014-2016)(2016) Mistchenko, Alicia SusanaAnualmente, aproximadamente en el 50% de las muestras de secreciones respiratorias de niños admitidos por infección respiratoria aguda baja no es posible detectar, por los métodos clásicos de inmunofluorescencia, ninguno de los virus asociado a las mismas. Las técnicas moleculares más conocidas, como la PCR, permitieron incrementar la tasa de recuperación en aproximadamente un 40% adicional. Sin embargo, frecuentemente se detecta la aparición de brotes epidémicos de virus para los cuales no tenemos inmunidad previa. Las características relevantes de un método que combina alto rendimiento y versatilidad, como es el caso de la tecnología de secuenciación masiva de ácidos nucleicos (NGS), abrieron nuevas perspectivas en investigación básica y consecuentemente en la aplicación para la detección de virus principalmente en brotes epidémicos. El objetivo del presente plan es desarrollar, optimizar e implementar nuevas técnicas de identificación viral para la detección de virus asociados a infección respiratoria aguda baja en niños. - Informe de investigador
Acceso Abierto Informe científico de investigador: Mistchenko, Alicia Susana (2012-2014)(2014) Mistchenko, Alicia SusanaEl objetivo de identificar (utilizando herramientas clínicas, epidemiológicas, virológicas y moleculares) nuevos virus, genotipos predominantes o co-circulación de variantes, constituyen en la actualidad una herramienta imprescindible para el estudio de brotes epidémicos, y requiere de los aportes de la Medicina, la Salud Pública y la Virología. Nuevas tecnologías como la secuenciación masiva (“next-generation sequence”) han empezado a desplazar, en muchos casos, a la secuenciación clásica con el método de Sanger. La aplicación de métodos de amplificación independientes de la secuencia como la técnica de Virus-Discovery-cDNA-AFLP permite identificar nuevos virus, detectar la circulación de variantes virales que no sean captadas por métodos convencionales (debido a mutaciones o recombinaciones), detectar cambios repentinos/eventuales de la secuencia o estudiar la diversidad de familias de virus que aún no han sido exploradas in extenso. El desarrollo de estas metodologías constituye un paso obligado para mantener un nivel acorde a lo exigido en la actualidad para la detección de virus. La versatilidad de las mismas nos permitirá su aplicación para al estudio de infección respiratoria aguda, en la vigilancia de síndrome febril agudo dentro del marco de casos sospechosos de dengue, o en el análisis de cuasiespecies de paramyxovirus en distintas poblaciones pediátricas.