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El secretoma estimado del hongo fitopatógeno Stemphylium lycopersici CIDEFI-216

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Resumen

El secretoma es el conjunto de proteínas exportadas por una célula. El estudio del secretoma de fitopatógenos es clave porque muchos efectores que modulan la interacción planta-patógeno son de naturaleza proteica. El objetivo del trabajo fue caracterizar el secretoma in silico del hongo fitopatógeno Stemphylium lycopersici CIDEFI-216. Este se predijo por la presencia en el proteoma teórico (GenBank: LGLR00000000.1) de péptidos señal de localización extracelu-lar y ausencia de dominios transmembranales (SignalP 4.1). Se evaluó el contenido de enzimas activas sobre carbohidratos o CAZymes (dbCAN), peptidasas y sus inhibidores (MEROPS), lipasas y otras hidrolasas de éster carboxílico (LED) y efectores (EffectorP, PHI-base). Se en-contró que S. lycopersici CIDEFI-216 tiene el potencial de secretar 1005 proteínas, incluyendo 356 CAZymes, 121 peptidasas, 9 inhibidores de peptidasas, 134 hidrolasas de éster carboxílico y 440 efectores. Estos datos son básicos para futuros estudios del secretoma in planta por el método de la huella peptídica.

Palabras clave
Secretoma
Stemphylium lycopersici
Biocontrol
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