Los microorganismos del suelo son fundamentales en la degradación enzimática de restos vegetales y su reciclado desde la fracción mineral del suelo. Su actividad depende del desarrollo del cultivo, el tipo y manejo del suelo y el macro y microclima del lugar .Los hongos celulolíticos son uno de los principales grupos involucrados en la degradación del rastrojo. El conocimiento de la tasa de descomposición de los residuos es fundamental para planificar su adecuado uso. El objetivo del presente trabajo fue cuantificar e identificar la población fúngica asociada a la degradación del rastrojo de trigo, bajo monocultivo, dos sistemas de labranza y dos dosis de fertilizante.